代謝通路基因組裝技術為生物制造提供新策略
| 來源:生物技術處【字號:大 中 小】
微生物細胞工廠已成為生產(chǎn)高附加值化學品的重要平臺。但由于微生物代謝通路往往是多基因構成復雜系統(tǒng),目標產(chǎn)物的高效合成需要實現(xiàn)基因表達的精確調控,因此實現(xiàn)人工精確設計和生物學組裝是成功構建細胞工廠的基礎。隨著代謝工程和合成生物學的不斷進步,核酸組裝技術已被用來優(yōu)化代謝途徑,但大多數(shù)技術只能實現(xiàn)對單個元件的調節(jié),少數(shù)多基因組裝技術由于基于傳統(tǒng)酶切連接或依賴PCR 擴增等策略,存在效率低,成本高,且容易引入其他突變等弊端。
為了同時實現(xiàn)理性設計和通量組裝,通量優(yōu)化通路,顯著提高代謝工程通路優(yōu)化的效率,在院重點部署項目支持下,微生物所婁春波課題組及陶勇課題組共同開發(fā)出代謝通路組裝新技術——OLMA (Oligo-linker Mediated Assembly)方法。該方法具有免PCR反應,簡易、高效等特點,可以同時組裝一個代謝通路的多個元件(庫),實現(xiàn)代謝通路的多靶點的組合優(yōu)化(可一次性實現(xiàn)八個靶點的通量組裝)。基于以上技術優(yōu)勢,OLMA方法成為一種利用合成生物學新方法設計和優(yōu)化代謝通路的范例。
OLMA方法在工業(yè)領域的應用主要集中在菌株改良和代謝途徑改造方面,目前已提供給研究人員進行生物學元件的標準化、生物途徑和線路的計算機輔助設計、代謝途徑的自動組裝等研究。同時這項技術的建立對于基因合成與組裝的高科技公司建立大片段DNA設計和合成技術及多元件組裝提供了新策略,目前該技術已用于商業(yè)服務-“代謝通路組裝服務”,可以實現(xiàn)從基因合成到載體文庫構建的一站式服務。
圖. 利用OLMA方法合成途徑組裝